המרכז פועל ברוח הפסוק "חביב אדם שנברא בצלם" – כבוד לכל אדם באשר הוא אדם. על כן המרכז מוביל מאבק בגזענות , וביחס מבזה ומפלה כלפי לא יהודים החיים במדינת ישראל, במיוחד כזה הנעשה בשם היהדות או המבוסס על המקורות היהודיים.
המרכז מקדם מאבק בגזענות באופנים הבאים:
- מאבק בהסתה גזענית כלפי ערבים וקבוצות נוספות (יוצאי ברה"מ, קהילה הלהט"ב, רפורמים ועוד), ודרישה להעמדה לדין פלילי עבור התבטאויות אלו. כאשר מדובר על רבנים מסיתים המועסקים בשירות המדינה נוספת גם דרישה להעמדה לדין משמעתי.
- הפעלת "המרכז לנפגעי ונפגעות גזענות" המעניק ליווי וסיוע משפטי ונפשי לקורבנות גזענות, מתעד את תופעות הגזענות ופועל למיגורה מול הממסד וכן מפעיל תכנית חינוכית הכוללת הרצאות ומפגשים מול רשויות, מוסדות חינוך, מכינות ועוד.
- חברות במספר קואליציות כנגד גזענות ובהן 'פורום 'תג מאיר' ו-'פורום ארגוני החברה האזרחית למאבק בגזענות' בריכוזה של היחידה הממשלתית למאבק בגזענות.
- פרסום דו"חות שונים בנושא: מצב ההסתה ברשתות החברתיות, גזענות ומגדר, גזענות בשם ההלכה, מחקר משווה בין אכיפת הסתה בקרב יהודים ובקרב ערבים, וכן דו"חות לעידוד חיים משותפים – "שנאה היא לא אופציה – קריאה לחיים משותפים ולמאבק בגזענות בישראל", ו- "רפואה שלמה – מערכת הבריאות בישראל כמודל לחיים משותפים של יהודים וערבים".
